Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ITGA4P13612 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms