Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTMAP06454 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTMAP06454 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTMAP06454 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTMAP06454 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTMAP06454 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTMAP06454 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTMAP06454 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PTMAP06454 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTMAP06454 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTMAP06454 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTMAP06454 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTMAP06454 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTMAP06454 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTMAP06454 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTMAP06454 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTMAP06454 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTMAP06454 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTMAP06454 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTMAP06454 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTMAP06454 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTMAP06454 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTMAP06454 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PTMAP06454 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTMAP06454 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTMAP06454 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTMAP06454 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTMAP06454 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTMAP06454 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTMAP06454 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTMAP06454 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTMAP06454 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTMAP06454 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTMAP06454 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTMAP06454 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTMAP06454 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTMAP06454 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTMAP06454 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTMAP06454 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTMAP06454 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTMAP06454 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTMAP06454 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTMAP06454 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTMAP06454 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTMAP06454 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTMAP06454 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTMAP06454 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTMAP06454 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTMAP06454 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTMAP06454 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTMAP06454 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTMAP06454 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTMAP06454 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTMAP06454 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTMAP06454 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTMAP06454 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTMAP06454 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTMAP06454 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTMAP06454 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTMAP06454 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTMAP06454 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTMAP06454 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTMAP06454 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTMAP06454 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTMAP06454 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTMAP06454 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTMAP06454 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTMAP06454 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTMAP06454 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTMAP06454 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTMAP06454 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTMAP06454 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTMAP06454 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTMAP06454 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTMAP06454 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTMAP06454 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTMAP06454 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTMAP06454 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTMAP06454 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTMAP06454 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTMAP06454 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTMAP06454 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTMAP06454 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTMAP06454 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTMAP06454 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTMAP06454 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTMAP06454 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTMAP06454 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTMAP06454 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTMAP06454 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTMAP06454 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTMAP06454 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTMAP06454 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTMAP06454 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTMAP06454 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTMAP06454 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTMAP06454 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTMAP06454 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTMAP06454 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTMAP06454 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms