Protein–RNA interactions for Protein: O95045

UPP2, Uridine phosphorylase 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP2O95045 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UPP2O95045 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UPP2O95045 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UPP2O95045 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UPP2O95045 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UPP2O95045 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UPP2O95045 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UPP2O95045 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UPP2O95045 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UPP2O95045 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
UPP2O95045 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UPP2O95045 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UPP2O95045 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UPP2O95045 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UPP2O95045 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UPP2O95045 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
UPP2O95045 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UPP2O95045 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UPP2O95045 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP2O95045 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP2O95045 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP2O95045 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP2O95045 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP2O95045 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP2O95045 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP2O95045 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP2O95045 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP2O95045 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP2O95045 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP2O95045 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP2O95045 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP2O95045 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP2O95045 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP2O95045 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP2O95045 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP2O95045 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP2O95045 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP2O95045 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP2O95045 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP2O95045 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP2O95045 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP2O95045 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP2O95045 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
UPP2O95045 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
UPP2O95045 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
UPP2O95045 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
UPP2O95045 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
UPP2O95045 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
UPP2O95045 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP2O95045 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP2O95045 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP2O95045 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP2O95045 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP2O95045 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP2O95045 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP2O95045 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP2O95045 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP2O95045 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP2O95045 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP2O95045 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP2O95045 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP2O95045 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP2O95045 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP2O95045 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP2O95045 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP2O95045 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP2O95045 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP2O95045 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP2O95045 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP2O95045 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP2O95045 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP2O95045 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP2O95045 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP2O95045 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP2O95045 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP2O95045 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP2O95045 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP2O95045 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP2O95045 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP2O95045 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP2O95045 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP2O95045 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP2O95045 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP2O95045 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP2O95045 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP2O95045 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP2O95045 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP2O95045 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP2O95045 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP2O95045 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UPP2O95045 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UPP2O95045 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UPP2O95045 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UPP2O95045 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UPP2O95045 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UPP2O95045 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UPP2O95045 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
UPP2O95045 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UPP2O95045 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UPP2O95045 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms