Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBDO15205 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBDO15205 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBDO15205 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBDO15205 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBDO15205 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBDO15205 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBDO15205 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBDO15205 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBDO15205 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBDO15205 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBDO15205 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBDO15205 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBDO15205 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBDO15205 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBDO15205 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBDO15205 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBDO15205 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBDO15205 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBDO15205 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBDO15205 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBDO15205 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBDO15205 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBDO15205 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBDO15205 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBDO15205 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBDO15205 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBDO15205 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBDO15205 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBDO15205 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBDO15205 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBDO15205 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBDO15205 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBDO15205 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBDO15205 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBDO15205 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBDO15205 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBDO15205 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBDO15205 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBDO15205 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBDO15205 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBDO15205 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBDO15205 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBDO15205 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBDO15205 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBDO15205 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
UBDO15205 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBDO15205 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBDO15205 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBDO15205 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBDO15205 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBDO15205 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBDO15205 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBDO15205 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBDO15205 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBDO15205 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBDO15205 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
UBDO15205 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBDO15205 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBDO15205 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBDO15205 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBDO15205 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBDO15205 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBDO15205 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBDO15205 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBDO15205 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBDO15205 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBDO15205 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBDO15205 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBDO15205 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBDO15205 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBDO15205 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UBDO15205 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBDO15205 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBDO15205 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBDO15205 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBDO15205 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBDO15205 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBDO15205 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBDO15205 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBDO15205 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBDO15205 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBDO15205 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBDO15205 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBDO15205 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBDO15205 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBDO15205 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBDO15205 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBDO15205 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UBDO15205 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBDO15205 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBDO15205 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBDO15205 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBDO15205 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBDO15205 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBDO15205 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBDO15205 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBDO15205 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBDO15205 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBDO15205 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms