Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms