Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
C9orf92A6NGG3 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms