Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
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