Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRPC4Q9UBN4 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms