Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms