Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCGF6Q9BYE7 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms