Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC106Q9BWC9 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms