Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf16Q9BUW7 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms