Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GORASP1Q9BQQ3 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms