Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAD9AQ99638 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms