Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB3IPQ96QF0 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms