Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BICD1Q96G01 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97 ms