Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ19

KCTD13, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD13Q8WZ19 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KCTD13Q8WZ19 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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