Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC12Q8WUD4 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms