Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SFRP1Q8N474 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
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