Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HACD2Q6Y1H2 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms