Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF549Q6P9A3 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms