Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF220Q5VTB9 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms