Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BRMS1LQ5PSV4 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms