Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HSD17B12Q53GQ0 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms