Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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