Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
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SGCAQ16586 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
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SGCAQ16586 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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SGCAQ16586 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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SGCAQ16586 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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SGCAQ16586 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SGCAQ16586 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
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SGCAQ16586 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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SGCAQ16586 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
SGCAQ16586 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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