Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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TUBA3CQ13748 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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TUBA3CQ13748 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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TUBA3CQ13748 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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TUBA3CQ13748 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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TUBA3CQ13748 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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TUBA3CQ13748 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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TUBA3CQ13748 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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TUBA3CQ13748 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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TUBA3CQ13748 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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TUBA3CQ13748 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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TUBA3CQ13748 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TUBA3CQ13748 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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