Protein–RNA interactions for Protein: Q13569

TDG, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDGQ13569 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDGQ13569 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDGQ13569 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDGQ13569 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDGQ13569 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDGQ13569 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TDGQ13569 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TDGQ13569 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TDGQ13569 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TDGQ13569 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDGQ13569 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDGQ13569 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDGQ13569 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDGQ13569 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDGQ13569 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDGQ13569 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TDGQ13569 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDGQ13569 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDGQ13569 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDGQ13569 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDGQ13569 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDGQ13569 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDGQ13569 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDGQ13569 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDGQ13569 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDGQ13569 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDGQ13569 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDGQ13569 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDGQ13569 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDGQ13569 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDGQ13569 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDGQ13569 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDGQ13569 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDGQ13569 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDGQ13569 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TDGQ13569 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDGQ13569 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDGQ13569 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDGQ13569 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDGQ13569 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TDGQ13569 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TDGQ13569 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDGQ13569 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TDGQ13569 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDGQ13569 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDGQ13569 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDGQ13569 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDGQ13569 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TDGQ13569 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDGQ13569 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDGQ13569 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TDGQ13569 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDGQ13569 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDGQ13569 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDGQ13569 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDGQ13569 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDGQ13569 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDGQ13569 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDGQ13569 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDGQ13569 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDGQ13569 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDGQ13569 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDGQ13569 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDGQ13569 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDGQ13569 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDGQ13569 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDGQ13569 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDGQ13569 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDGQ13569 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDGQ13569 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDGQ13569 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TDGQ13569 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TDGQ13569 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TDGQ13569 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDGQ13569 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDGQ13569 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDGQ13569 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDGQ13569 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDGQ13569 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDGQ13569 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDGQ13569 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDGQ13569 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDGQ13569 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDGQ13569 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDGQ13569 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDGQ13569 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDGQ13569 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDGQ13569 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDGQ13569 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDGQ13569 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDGQ13569 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDGQ13569 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDGQ13569 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDGQ13569 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDGQ13569 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TDGQ13569 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDGQ13569 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDGQ13569 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDGQ13569 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TDGQ13569 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms