Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 RPS26-201ENST00000356464 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 PAICSP2-201ENST00000429118 1150 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CAMK2BQ13554 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms