Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 EDARADD-202ENST00000359362 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 CTNNB1-201ENST00000349496 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 AC004241.1-201ENST00000547799 3299 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 RBM15-205ENST00000618772 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 ZNF148-206ENST00000485866 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 PDZD4-209ENST00000544474 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 TP53TG5-201ENST00000372726 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UBE2V1Q13404 HERC3-203ENST00000407637 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms