Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NR1H3Q13133 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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