Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CHAF1AQ13111 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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