Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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FOXD4Q12950 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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FOXD4Q12950 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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FOXD4Q12950 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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FOXD4Q12950 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FOXD4Q12950 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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