Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP160Q12769 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP160Q12769 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP160Q12769 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP160Q12769 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP160Q12769 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP160Q12769 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP160Q12769 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP160Q12769 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP160Q12769 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP160Q12769 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP160Q12769 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP160Q12769 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP160Q12769 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP160Q12769 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP160Q12769 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP160Q12769 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP160Q12769 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP160Q12769 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP160Q12769 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP160Q12769 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUP160Q12769 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms