Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
DEFA6Q01524 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms