Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
E2F1Q01094 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2F1Q01094 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms