Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SKP1P63208 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SKP1P63208 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SKP1P63208 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SKP1P63208 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP1P63208 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP1P63208 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP1P63208 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP1P63208 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP1P63208 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP1P63208 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP1P63208 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP1P63208 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP1P63208 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP1P63208 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP1P63208 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP1P63208 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP1P63208 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP1P63208 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP1P63208 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP1P63208 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP1P63208 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP1P63208 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP1P63208 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP1P63208 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP1P63208 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP1P63208 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP1P63208 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP1P63208 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP1P63208 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP1P63208 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP1P63208 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP1P63208 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP1P63208 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP1P63208 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP1P63208 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP1P63208 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP1P63208 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP1P63208 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP1P63208 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP1P63208 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP1P63208 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP1P63208 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP1P63208 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP1P63208 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP1P63208 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP1P63208 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP1P63208 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP1P63208 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP1P63208 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SKP1P63208 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP1P63208 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP1P63208 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP1P63208 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP1P63208 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP1P63208 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP1P63208 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP1P63208 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP1P63208 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP1P63208 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP1P63208 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP1P63208 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP1P63208 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP1P63208 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP1P63208 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP1P63208 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP1P63208 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP1P63208 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP1P63208 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP1P63208 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP1P63208 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP1P63208 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP1P63208 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP1P63208 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP1P63208 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP1P63208 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP1P63208 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP1P63208 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP1P63208 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP1P63208 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP1P63208 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP1P63208 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP1P63208 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP1P63208 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP1P63208 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP1P63208 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP1P63208 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP1P63208 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP1P63208 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP1P63208 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP1P63208 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP1P63208 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP1P63208 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SKP1P63208 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP1P63208 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP1P63208 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP1P63208 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP1P63208 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP1P63208 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP1P63208 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms