Protein–RNA interactions for Protein: P51787

KCNQ1, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1P51787 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KCNQ1P51787 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms