Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PLNP26678 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PLNP26678 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PLNP26678 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PLNP26678 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PLNP26678 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PLNP26678 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PLNP26678 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PLNP26678 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PLNP26678 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PLNP26678 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PLNP26678 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PLNP26678 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PLNP26678 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PLNP26678 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PLNP26678 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PLNP26678 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PLNP26678 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PLNP26678 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PLNP26678 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PLNP26678 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PLNP26678 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PLNP26678 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PLNP26678 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PLNP26678 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PLNP26678 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PLNP26678 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PLNP26678 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PLNP26678 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PLNP26678 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PLNP26678 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PLNP26678 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PLNP26678 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PLNP26678 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PLNP26678 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PLNP26678 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PLNP26678 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PLNP26678 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PLNP26678 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PLNP26678 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PLNP26678 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PLNP26678 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PLNP26678 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PLNP26678 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PLNP26678 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PLNP26678 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PLNP26678 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PLNP26678 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PLNP26678 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PLNP26678 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PLNP26678 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PLNP26678 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PLNP26678 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PLNP26678 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PLNP26678 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PLNP26678 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PLNP26678 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PLNP26678 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PLNP26678 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PLNP26678 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PLNP26678 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PLNP26678 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PLNP26678 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PLNP26678 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PLNP26678 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PLNP26678 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PLNP26678 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PLNP26678 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PLNP26678 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PLNP26678 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PLNP26678 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PLNP26678 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PLNP26678 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PLNP26678 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PLNP26678 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PLNP26678 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PLNP26678 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PLNP26678 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PLNP26678 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PLNP26678 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PLNP26678 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PLNP26678 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PLNP26678 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PLNP26678 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PLNP26678 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PLNP26678 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PLNP26678 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PLNP26678 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PLNP26678 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PLNP26678 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PLNP26678 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PLNP26678 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PLNP26678 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PLNP26678 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PLNP26678 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PLNP26678 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PLNP26678 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PLNP26678 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PLNP26678 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PLNP26678 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms