Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5F1P24539 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms