Protein–RNA interactions for Protein: P22888

LHCGR, Lutropin-choriogonadotropic hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHCGRP22888 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms