Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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PTPRAP18433 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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PTPRAP18433 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRAP18433 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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