Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH1P12830 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH1P12830 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH1P12830 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH1P12830 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH1P12830 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH1P12830 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH1P12830 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH1P12830 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH1P12830 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH1P12830 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDH1P12830 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH1P12830 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH1P12830 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH1P12830 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH1P12830 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH1P12830 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH1P12830 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH1P12830 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH1P12830 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH1P12830 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH1P12830 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH1P12830 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH1P12830 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH1P12830 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH1P12830 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH1P12830 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH1P12830 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH1P12830 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH1P12830 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH1P12830 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH1P12830 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH1P12830 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH1P12830 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH1P12830 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH1P12830 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH1P12830 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH1P12830 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH1P12830 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH1P12830 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH1P12830 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH1P12830 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH1P12830 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH1P12830 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH1P12830 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH1P12830 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH1P12830 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH1P12830 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH1P12830 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH1P12830 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH1P12830 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH1P12830 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH1P12830 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH1P12830 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH1P12830 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH1P12830 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH1P12830 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH1P12830 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH1P12830 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH1P12830 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDH1P12830 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDH1P12830 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDH1P12830 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDH1P12830 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CDH1P12830 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH1P12830 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH1P12830 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH1P12830 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH1P12830 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH1P12830 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH1P12830 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH1P12830 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH1P12830 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH1P12830 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH1P12830 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH1P12830 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH1P12830 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH1P12830 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH1P12830 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH1P12830 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH1P12830 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH1P12830 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH1P12830 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH1P12830 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH1P12830 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH1P12830 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH1P12830 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH1P12830 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH1P12830 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH1P12830 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH1P12830 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH1P12830 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH1P12830 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH1P12830 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH1P12830 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH1P12830 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH1P12830 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH1P12830 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH1P12830 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CDH1P12830 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms