Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAF1Q9H7N4 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAF1Q9H7N4 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAF1Q9H7N4 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAF1Q9H7N4 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAF1Q9H7N4 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAF1Q9H7N4 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAF1Q9H7N4 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAF1Q9H7N4 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAF1Q9H7N4 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAF1Q9H7N4 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAF1Q9H7N4 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAF1Q9H7N4 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAF1Q9H7N4 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAF1Q9H7N4 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAF1Q9H7N4 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAF1Q9H7N4 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAF1Q9H7N4 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAF1Q9H7N4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAF1Q9H7N4 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAF1Q9H7N4 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAF1Q9H7N4 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAF1Q9H7N4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAF1Q9H7N4 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAF1Q9H7N4 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAF1Q9H7N4 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAF1Q9H7N4 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAF1Q9H7N4 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAF1Q9H7N4 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAF1Q9H7N4 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAF1Q9H7N4 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAF1Q9H7N4 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAF1Q9H7N4 UCHL3-206ENST00000618773 1050 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAF1Q9H7N4 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAF1Q9H7N4 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAF1Q9H7N4 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAF1Q9H7N4 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAF1Q9H7N4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAF1Q9H7N4 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAF1Q9H7N4 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAF1Q9H7N4 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAF1Q9H7N4 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAF1Q9H7N4 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAF1Q9H7N4 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAF1Q9H7N4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAF1Q9H7N4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAF1Q9H7N4 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAF1Q9H7N4 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAF1Q9H7N4 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAF1Q9H7N4 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAF1Q9H7N4 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAF1Q9H7N4 COA1-202ENST00000310564 1085 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAF1Q9H7N4 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAF1Q9H7N4 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAF1Q9H7N4 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAF1Q9H7N4 ZRANB2-AS1-201ENST00000426999 607 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAF1Q9H7N4 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAF1Q9H7N4 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAF1Q9H7N4 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms