Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF17Q9BXT8 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNF17Q9BXT8 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms