Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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TMEM43Q9BTV4 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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TMEM43Q9BTV4 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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TMEM43Q9BTV4 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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TMEM43Q9BTV4 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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TMEM43Q9BTV4 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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TMEM43Q9BTV4 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TMEM43Q9BTV4 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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