Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms