Protein–RNA interactions for Protein: Q96QH2

PRAM1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAM1Q96QH2 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAM1Q96QH2 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms