Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RTP4Q96DX8 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms