Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ8

BHLHE22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE22Q8NFJ8 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHE22Q8NFJ8 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms